สำนักงานคณะกรรมการการศึกษาขั้นพื้นฐาน (สพฐ.) ได้จัดตั้งเครือข่ายเพื่อการพัฒนาห้องเรียนพิเศษวิทยาศาสตร์ขึ้นตามนโยบายของรัฐบาล โดยคำแถลงนโยบายของคณะรัฐมนตรีต่อรัฐสภา เมื่อวันพุธที่ 23 มีนาคม 2548 โดยความร่วมมือกับสำนักงานคณะกรรมการการอุดมศึกษา (สกอ.) สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ (สวทช.) และสถาบันส่งเสริมการสอนวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี (สสวท.) มีประกาศ ณ วันที่ 3 พฤศจิกายน 2551 โดยคุณหญิงกษมา วรวรรณ ณ อยุธยา ดำรงตำแหน่งเลขาธิการคณะกรรมการการศึกษาขึ้นพื้นฐาน ในขณะนั้น มีจุดมุ่งหมายในการส่งเสริมการพัฒนานักเรียนให้สามารถศึกษาต่อในระดับสูงขึ้นจนมีศักยภาพด้านวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี อันจะเป็นกำลังสำคัญต่อการพัฒนาประเทศ